RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421404.1

RAD23BP1-201, Transcript of RAD23 homolog B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RAD23BP1, Length 1,227 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP1-201ENST00000421404 HTR3DQ70Z44 454 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TMEM150AQ86TG1 271 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TADA2BQ86TJ2 420 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TAC4Q86UU9 113 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 KBTBD6Q86V97 674 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 CCDC185Q8N715 623 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PRELID2Q8N945 189 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 LEMD2Q8NC56 503 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 KCTD6Q8NC69 237 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 RNF139Q8WU17 664 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SMARCD2Q92925 531 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TCEAL3Q969E4 200 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 FBXO32Q969P5 355 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 CHFRQ96EP1 664 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SERPINB11Q96P15 392 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 RNF157Q96PX1 679 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SARGQ9BW04 601 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PNPOQ9NVS9 261 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DDIT4Q9NX09 232 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 FLNCQ14315 2725 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 LRRD1A4D1F6 860 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DRGXA6NNA5 263 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 F2RL2O00254 374 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TLR5O60602 858 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PRAMEF12O95522 483 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 APOC2P02655 101 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 CD48P09326 243 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 KRT10P13645 584 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 C6P13671 934 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PTPN2P17706 415 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PSMC3P17980 439 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TGM2P21980 687 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 MPLP40238 635 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 PIK3CGP48736 1102 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 NR2C2P49116 596 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DNA2P51530 1060 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 CDH6P55285 790 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TWF1Q12792 350 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 NME3Q13232 169 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 XRCC4Q13426 336 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DPYSQ14117 519 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TEAD2Q15562 447 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 CA9Q16790 459 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 CDO1Q16878 200 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ODF2Q5BJF6 829 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TEX35Q5T0J7 233 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 HECTD3Q5T447 861 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 MANEALQ5VSG8 457 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 ANKS6Q68DC2 871 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 WDR93Q6P2C0 686 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 FAM131BQ86XD5 332 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD23BP1-201ENST00000421404 TMC8Q8IU68 726 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms