RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373201.5

PTPRT-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-207ENST00000373201 TIFAQ96CG3 184 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CENPMQ9NSP4 180 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ABCA8O94911 1581 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CDK14O94921 469 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 LINGO4Q6UY18 593 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 APOLD1Q96LR9 279 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TET3O43151 1660 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 NRP2O60462 931 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ITGB1P05556 798 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 DPYSQ14117 519 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 LINGO2Q7L985 606 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 GPR180Q86V85 440 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 E7EQ34 232 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CD247P20963 164 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 AP3S2P59780 193 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 NMUR1Q9HB89 426 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TECPR2O15040 1411 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 A0A0A0MRY4 1105 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 RAB10P61026 200 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 NFKB2Q00653 900 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ELOA3BQ3SY89 546 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 BICRALQ6AI39 1079 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 RAD9BQ6WBX8 426 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ELOA3Q8NG57 546 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 RDH11Q8TC12 318 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 SPATA13Q96N96 652 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 MED28Q9H204 178 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 METTL7AQ9H8H3 244 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 SPAG4Q9NPE6 437 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TMEM51Q9NW97 253 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 A0A1W2PQH9 124 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 AKAP3O75969 853 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ITIH1P19827 911 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 MAP3K8P41279 467 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 MAP2K5Q13163 448 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 GRB10Q13322 594 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 SCGB2A1O75556 95 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TAF10Q12962 218 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ITGA7Q13683 1181 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 DPYSL3Q14195 570 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 PLGLAQ15195 96 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 RGMBQ6NW40 437 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 OR5T2Q8NGG2 359 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 EGFL7Q9UHF1 273 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 WNT10BO00744 389 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 GABBR2O75899 941 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ASMTP46597 345 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ADARP55265 1226 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CTBP1Q13363 440 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CDK10Q15131 360 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TMEM151BQ8IW70 566 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TNFP01375 233 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ATP4AP20648 1035 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 IFT27Q9BW83 186 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 SLC22A3O75751 556 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ADSSP30520 456 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ICAM3P32942 547 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 C3orf33Q6P1S2 294 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 AADATQ8N5Z0 425 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TMEM145Q8NBT3 493 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 NETO2Q8NC67 525 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 NSMCE3Q96MG7 304 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 UPB1Q9UBR1 384 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 PRR36Q9H6K5 1346 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 CBX6O95503 412 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 TMX2Q9Y320 296 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 IRF6O14896 467 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 HEXDCQ8WVB3 486 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 LGR4Q9BXB1 951 aa9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
PTPRT-207ENST00000373201 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms