RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370542.1

LMO4-201, Transcript of LIM domain only 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO4, Length 1,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4-201ENST00000370542 IL12RB2Q99665 862 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 LRP4O75096 1905 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 YY2O15391 372 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 CSO75390 466 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 LRCH4O75427 683 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SPAG6O75602 509 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 CBX6O95503 412 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 C6P13671 934 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ERCC2P18074 760 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 CRABP2P29373 138 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 GSTT1P30711 240 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 CSRP3P50461 194 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 BLKP51451 505 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 HK3P52790 923 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 TLE3Q04726 772 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 DPYSQ14117 519 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NR0B2Q15466 257 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 DBN1Q16643 649 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 CDKN3Q16667 212 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 LRRC38Q5VT99 294 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 LZTR1Q8N653 840 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NPWQ8N729 165 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 WDR48Q8TAF3 677 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 MAPK15Q8TD08 544 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 C9orf72Q96LT7 481 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 PSKH2Q96QS6 385 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 USP12O75317 370 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SPAG7O75391 227 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 LYNP07948 512 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 TRIM23P36406 574 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 PGM1P36871 562 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SERPINB4P48594 390 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 IL10RBQ08334 325 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 RALGDSQ12967 914 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 MTM1Q13496 603 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 C1orf61Q13536 156 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NFATC4Q14934 902 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 DPYSL2Q16555 572 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ALG11Q2TAA5 492 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 P3H1Q32P28 736 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 LIN52Q52LA3 116 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 PERM1Q5SV97 790 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 RNF220Q5VTB9 566 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ACAD11Q709F0 780 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 GLMNQ92990 594 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NAT6Q93015 286 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 APOOQ9BUR5 198 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ABCG4Q9H172 646 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 C1orf21Q9H246 121 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NPHS2Q9NP85 383 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 NDE1Q9NXR1 346 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 HEY2Q9UBP5 337 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO4-201ENST00000370542 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms