RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 ZNF540Q8NDQ6 660 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC13-201ENST00000366661 NCLNQ969V3 563 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC13-201ENST00000366661 LAMA3Q16787 3333 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC13-201ENST00000366661 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 E5RI56 91 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SBK3P0C264 359 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NPTX1Q15818 432 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 UBE2FQ969M7 185 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 DTLQ9NZJ0 730 aa15.21■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CCDC154A6NI56 674 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AKR7A2O43488 359 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 B4GALT4O60513 344 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CABYRO75952 493 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 EPN2O95208 641 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 LSM8O95777 96 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CDONQ4KMG0 1287 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AHSA2Q719I0 299 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CDH24Q86UP0 819 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GTF2H4Q92759 462 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 LPPQ93052 612 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 VAT1Q99536 393 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MAP10Q9P2G4 905 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NRCAMQ92823 1304 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MFSD11O43934 449 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CHRNA1P02708 482 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MSH3P20585 1137 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GSTM2P28161 218 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GGT5P36269 586 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 OR3A3P47888 321 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 DIO3P55073 304 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 OR4D2P58180 307 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GTF2H3Q13889 308 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CDK10Q15131 360 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ACOT1Q86TX2 421 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 HEXDCQ8WVB3 486 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 WNT8BQ93098 351 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MYRFLQ96LU7 910 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 COPS4Q9BT78 406 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.2■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 A0A0X1KG70 313 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GPR32O75388 356 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ANGPTL1O95841 491 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SLC9A3P48764 834 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CPT1AP50416 773 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NDST1P52848 882 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SLAMF1Q13291 335 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ZMYND11Q15326 602 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 TP53INP1Q96A56 240 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 Q96MT0 163 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 YME1L1Q96TA2 773 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SMIM30A4D0T7 59 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 GSTA4O15217 222 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 SURF1Q15526 300 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AGAP6Q5VW22 663 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 LSMEM1Q8N8F7 131 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 AGAP4Q96P64 663 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 LIMD1Q9UGP4 676 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MGAMO43451 1857 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MT-ND2P03891 347 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 MPOP05164 745 aa15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC13-201ENST00000366661 DARSP14868 501 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms