RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357052.7

RAB4B-201, Transcript of RAB4B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB4B, Length 1,133 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4B-201ENST00000357052 HACD1B0YJ81 288 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ARHGAP6O43182 974 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 NDUFA10O95299 355 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 HLA-DPA1P20036 260 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 TLE1Q04724 770 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 MPP3Q13368 585 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ITGA9Q13797 1035 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RNF214Q8ND24 703 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RNF31Q96EP0 1072 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 GPR39O43194 453 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 KIAA0754O94854 1291 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF28P17035 718 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 DLSTP36957 453 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CTSCP53634 463 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 DMPKQ09013 629 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 SEPT6Q14141 434 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RPE65Q16518 533 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 KLHL35Q6PF15 583 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 RAB33BQ9H082 229 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CROTQ9UKG9 612 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 OR2AG2A6NM03 316 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 H7C0C1 242 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 KATNA1O75449 491 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 SPAG6O75602 509 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 SPTBP11277 2137 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 FGF5P12034 268 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 MSH3P20585 1137 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 FECHP22830 423 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 F8A1P23610 371 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ATP5OP48047 213 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 PLCL1Q15111 1095 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CCDC181Q5TID7 509 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 BBS12Q6ZW61 710 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF398Q8TD17 642 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 PDE7BQ9NP56 450 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 KCND3Q9UK17 655 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 KCTD3Q9Y597 815 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 ANXA9O76027 345 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 AGTP01019 485 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 APOC2P02655 101 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 MT-ND3P03897 115 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 AKT1P31749 480 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 CA5AP35218 305 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 MARCKSL1P49006 195 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 GEMP55040 296 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 PPP1CAP62136 330 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 XRCC4Q13426 336 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 NFE2L1Q14494 772 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB4B-201ENST00000357052 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms