RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 RINLQ6ZS11 566 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 Q6ZVL8 140 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 MTSS1LQ765P7 747 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 TDHQ8IZJ6 230 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 OR56A4Q8NGH8 313 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 AGAP11Q8TF27 550 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 FAM129BQ96TA1 746 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 MIPEPQ99797 713 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PCTPQ9UKL6 214 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 TRANK1O15050 2925 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 TMEM233B4DJY2 109 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 WNT9AO14904 365 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 AREL1O15033 823 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 FFAR2O15552 330 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 DCXO43602 365 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 KAT7O95251 611 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ESRRBO95718 433 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 APODP05090 189 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 MPC1LP0DKB6 136 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 AOAHP28039 575 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ETV3P41162 512 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CDH13P55290 713 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 MESP2Q0VG99 397 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 PELI3Q8N2H9 469 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 COQ10AQ96MF6 247 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ZNF382Q96SR6 550 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 HDAC8Q9BY41 377 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 SARDHQ9UL12 918 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 COL4A3Q01955 1670 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 NEMP1O14524 444 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 SLC16A5O15375 505 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 NUAK1O60285 661 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 FTH1P02794 183 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 JUNP05412 331 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 VCLP18206 1134 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 MSH3P20585 1137 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ATP4BP51164 291 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CDKL1Q00532 357 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ENPP2Q13822 863 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 NXNQ6DKJ4 435 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ZNF366Q8N895 744 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 UBTD2Q8WUN7 234 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ARRDC3Q96B67 414 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 DTD2Q96FN9 168 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 RTKNQ9BST9 563 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ABCG8Q9H221 673 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 EPHX3Q9H6B9 360 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 DYRK4Q9NR20 520 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 CDH22Q9UJ99 828 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 E2F3O00716 465 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 GIPC1O14908 333 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 C8GP07360 202 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 UROSP10746 265 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 COX4I1P13073 169 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 HLA-EP13747 358 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ADRB3P13945 408 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 GDI1P31150 447 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 AKT1P31749 480 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 TNFRSF4P43489 277 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 RAP1GDS1P52306 607 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 DPTQ07507 201 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 SP140Q13342 867 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 ACOX1Q15067 660 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 SNCBQ16143 134 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 TCAIMQ8N3R3 496 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 MAGEC3Q8TD91 643 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 SCAMP4Q969E2 229 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 GLYATL1Q969I3 302 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 AP2M1Q96CW1 435 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-202ENST00000338546 C19orf60Q96EN9 201 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms