RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 IL12AP29459 219 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HMGCS1Q01581 520 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CD47Q08722 323 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF7Q14155 803 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TEX37Q96LM6 180 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TPK1Q9H3S4 243 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 EHD3Q9NZN3 535 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.14■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF487B1APH4 448 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 RAMP2O60895 175 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 G6PDP11413 515 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CLCNKBP51801 687 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 DNAJB13P59910 316 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OR4D1Q15615 310 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SPANXN2Q5MJ10 180 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 LCN8Q6JVE9 175 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GALNT10Q86SR1 603 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SCML4Q8N228 414 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PDPRQ8NCN5 879 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TSSK3Q96PN8 268 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 IPPQ9Y573 584 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TMEM221A6NGB7 291 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 EVPLLA8MZ36 301 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 UMPSP11172 480 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CD36P16671 472 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MAGEA12P43365 314 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CRY1Q16526 586 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 25
USP25-201ENST00000285679 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SPARTQ8N0X7 666 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PELI3Q8N2H9 469 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 LEMD2Q8NC56 503 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HMCESQ96FZ2 354 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 OR52E6Q96RD3 313 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PRRG3Q9BZD7 231 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SIPA1L1O43166 1804 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GPR182O15218 404 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 DFNA5O60443 496 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SERPINF2P08697 491 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 LHX1P48742 406 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PTGR1Q14914 329 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.13■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 NRCAMQ92823 1304 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 NIPSNAP2O75323 286 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 WDR47O94967 919 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MED26O95402 600 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 IRF1P10914 325 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MSH3P20585 1137 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 HID1Q8IV36 788 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 LGI2Q8N0V4 545 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CADM3Q8N126 398 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 STX19Q8N4C7 294 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 GPR78Q96P69 363 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CGREF1Q99674 301 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 COL4A5P29400 1685 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 IQCF5A8MTL0 148 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 ECI2O75521 394 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SERPINA1P01009 418 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 RAB15P59190 212 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 IL2P60568 153 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CREB5Q02930 508 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 EPS8Q12929 822 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 DDR2Q16832 855 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 CITED4Q96RK1 184 aa15.12■□□□□ 0.01
USP25-201ENST00000285679 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms