RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239165.8

HOXB7-201, Transcript of homeobox B7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB7, Length 1,371 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7-201ENST00000239165 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
HOXB7-201ENST00000239165 FAM159BA6NKW6 160 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PFDN6O15212 129 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GRID2O43424 1007 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PRLHRP49683 370 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 LRP8Q14114 963 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 KYNUQ16719 465 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 LRRC6Q86X45 466 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GALNT13Q8IUC8 556 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 OR2M4Q96R27 311 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PRR19A6NJB7 356 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 QSOX1O00391 747 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 OR1I1O60431 355 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PIAS2O75928 621 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 STX2P32856 288 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 LRRTM4Q86VH4 590 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SAP25Q8TEE9 199 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CDC6Q99741 560 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 TIMM29Q9BSF4 260 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 LRRC61Q9BV99 259 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SPEGQ15772 3267 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 KLHL33A6NCF5 533 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 KMOO15229 486 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 NDUFS3O75489 264 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GNPDA1P46926 289 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CLCNKAP51800 687 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CTBP1Q13363 440 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 TMEM220Q6QAJ8 160 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CLDN19Q8N6F1 224 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SGF29Q96ES7 293 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 BIRC8Q96P09 236 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 TMEM168Q9H0V1 697 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 SPASTQ9UBP0 616 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PTPRBP23467 1997 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 KCNJ13O60928 360 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 DKK1O94907 266 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ABHD2P08910 425 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GSTM1P09488 218 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 DGKAP23743 735 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GABRB3P28472 473 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PHBP35232 272 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GRK6P43250 576 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PMS2P54278 862 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 IL9RQ01113 521 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 GSTM4Q03013 218 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 DMPKQ09013 629 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 FBF1Q8TES7 1133 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 CLPBQ9H078 707 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ZFATQ9P243 1243 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ST14Q9Y5Y6 855 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 OR2AG2A6NM03 316 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 KRT37O76014 449 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ESR1P03372 595 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 MPP1Q00013 466 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 NAB1Q13506 487 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXB7-201ENST00000239165 ELOCQ15369 112 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms