RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 GDE1Q9NZC3 331 aa23.61■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH22Q9UJ99 828 aa23.61■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 OARD1Q9Y530 152 aa23.61■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 C16orf96A6NNT2 1141 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 E2F3O00716 465 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CD1EP15812 388 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC6Q16204 474 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM219BQ5XKK7 198 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ERAP2Q6P179 960 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CYHR1Q6ZMK1 362 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 EGFL8Q99944 293 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PBX4Q9BYU1 374 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 AKTIPQ9H8T0 292 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 NDE1Q9NXR1 346 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 GUCA1CO95843 209 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CBSLP0DN79 551 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CBSP35520 551 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC6A11P48066 632 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 B4GALNT1Q00973 533 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ART3Q13508 389 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 SYVN1Q86TM6 617 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 NXPE3Q969Y0 559 aa23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 TRANK1O15050 2925 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 UROSP10746 265 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 DCDC1P59894 354 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNC3Q14003 757 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 Q6ZVL8 140 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PDPRQ8NCN5 879 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 SCAMP4Q969E2 229 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 TUBGCP3Q96CW5 907 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL42Q9P2K6 505 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 MSRAQ9UJ68 235 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 BTRCQ9Y297 605 aa23.59■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1B0GTL3 188 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PRRT4C9JH25 899 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CFAP99D6REC4 459 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS4BO75351 444 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMG1O95456 288 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 LINC00032P0C843 101 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 VCLP18206 1134 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ETV3P41162 512 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC16Q13042 620 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PDGFRLQ15198 375 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 RCN1Q15293 331 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 AGKQ53H12 422 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 DPPA4Q7L190 304 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 DET1Q7L5Y6 550 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 DSELQ8IZU8 1212 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF382Q96SR6 550 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 SMOXQ9NWM0 555 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 OBP2AQ9NY56 170 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 ASB1Q9Y576 335 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 TIMM22Q9Y584 194 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa23.58■■□□□ 1.37
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT36O76013 467 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE5AO76074 875 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ANP32DO95626 131 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 PRNPP04156 253 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 PKNOX1P55347 436 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ACTR3P61158 418 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 STX5Q13190 355 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 KIF19Q2TAC6 998 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF284Q2VY69 593 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 GK5Q6ZS86 529 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC167Q9P0B6 97 aa23.58■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH23Q9H251 3354 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ELFN1P0C7U0 828 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP4BP51164 291 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR149Q86SP6 731 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXW8Q8N3Y1 598 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP6V1E2Q96A05 226 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINI1Q99574 410 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 TUBB1Q9H4B7 451 aa23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RPUSD1-201ENST00000007264 MESP2Q0VG99 397 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms