RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 HECTD3Q5T447 861 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.25■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CLDN11O75508 207 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ARSAP15289 507 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SGSHP51688 502 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 UNC50Q53HI1 259 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ADI1Q9BV57 179 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 NANOGQ9H9S0 305 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 INSIG1O15503 277 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SUPT7LO94864 414 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 BCL10O95999 233 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ALOX5P09917 674 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PRSS56P0CW18 603 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ARPC4P59998 168 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF347Q96SE7 839 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 TCF12Q99081 682 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 EHD1Q9H4M9 534 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PARVBQ9HBI1 364 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 GKN1Q9NS71 199 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ADA2Q9NZK5 511 aa20.24■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 TRIM24O15164 1050 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 STC2O76061 302 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PRLP01236 227 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PSME3P61289 254 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC36A3Q495N2 470 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PLD4Q96BZ4 506 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SCLYQ96I15 445 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 EXOC2Q96KP1 924 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 NPAS2Q99743 824 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ILVBLA1L0T0 632 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SEC24AO95486 1093 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CPNE6O95741 557 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 GNRH1P01148 92 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 TSPAN8P19075 237 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 HERVK_113P63132 956 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 MERTKQ12866 999 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 OR13F1Q8NGS4 319 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 LPGAT1Q92604 370 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 HPS1Q92902 700 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 NDEL1Q9GZM8 345 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 RHOCP08134 193 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 MTHFD2P13995 350 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 FAM219BQ5XKK7 198 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 GK5Q6ZS86 529 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 RMDN1Q96DB5 314 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 MRGBPQ9NV56 204 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 H3BMM5 538 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 UBDO15205 165 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 F11P03951 625 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 PSMA3P25788 255 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 MLLT10P55197 1068 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 OR4D1Q15615 310 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 EML3Q32P44 896 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.22■□□□□ 0.83
HDGFL2-208ENST00000616600 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms