RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 PHLPP1O60346 1717 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CCNFP41002 786 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PTCHD4Q6ZW05 846 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 HAPLN3Q96S86 360 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 RHBDL2Q9NX52 303 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 SATB2Q9UPW6 733 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 TIMM22Q9Y584 194 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 NRP2O60462 931 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 FAM155BO75949 473 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 RFX4Q33E94 735 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 KRT74Q7RTS7 529 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEB3O15480 346 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 VPS26BQ4G0F5 336 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 NPAS2Q99743 824 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 GINS4Q9BRT9 223 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 DIABLOQ9NR28 239 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 KLF15Q9UIH9 416 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ATRNL1Q5VV63 1379 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CLCQ05315 142 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 IRF2BP1Q8IU81 584 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 NPLOC4Q8TAT6 608 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ACDQ96AP0 544 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 MFSD3Q96ES6 412 aa19.99■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 SAGP10523 405 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 IL12BP29460 328 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC73Q5JTD7 316 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 LRP10Q7Z4F1 713 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 AMZ2Q86W34 360 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PTPN18Q99952 460 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ALKBH4Q9NXW9 302 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 EHD3Q9NZN3 535 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CACNG4Q9UBN1 327 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 B3GALT2O43825 422 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 NOL4O94818 638 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 UBXN7O94888 489 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 NMBRP28336 390 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 AQP1P29972 269 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 LIMK2P53671 638 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PIK3C3Q8NEB9 887 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 WDR26Q9H7D7 661 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 SIRPGQ9P1W8 387 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CCNIQ14094 377 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ZYG11AQ6WRX3 759 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 MPP4Q96JB8 637 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 TAPBPLQ9BX59 468 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 TLR9Q9NR96 1032 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 SH3GLB1Q9Y371 365 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CYP4F3Q08477 520 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 AMZ1Q400G9 498 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ENPP7Q6UWV6 458 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 UBASH3BQ8TF42 649 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 AZIN2Q96A70 460 aa19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 A0A0U1RQF3 1178 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PFKMP08237 780 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 HOXC12P31275 282 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 MBLAC2Q68D91 279 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 GK5Q6ZS86 529 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 SLIT2O94813 1529 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 OMPP47874 163 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 FAM91A1Q658Y4 838 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CLEC20AQ6ZU45 233 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 UNC93B1Q9H1C4 597 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 S100GP29377 79 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 GRB14Q14449 540 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB6Q15916 424 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ARSIQ5FYB1 569 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 PRSS58Q8IYP2 241 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 SIPA1Q96FS4 1042 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 RTKNQ9BST9 563 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 C9IYK1 514 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 WNT9AO14904 365 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 UROSP10746 265 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 COL6A1P12109 1028 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 OGNP20774 298 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 GJA9P57773 515 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 LCP2Q13094 533 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 CLEC4CQ8WTT0 213 aa19.97■□□□□ 0.79
CTDP1-208ENST00000613122 EPB41L1Q9H4G0 881 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms