RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 SCN2BO60939 215 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 NCK1P16333 377 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 EVX2Q03828 476 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.86□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 NDST3O95803 873 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 HTR1BP28222 390 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 LAPTM5Q13571 262 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GPR142Q7Z601 462 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ZZZ3Q8IYH5 903 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 DPF3Q92784 378 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CNPPD1Q9BV87 410 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 H3BNH8 94 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CCNB2O95067 398 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MT-ND1P03886 318 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ICAM3P32942 547 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SCN1BQ07699 218 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 DGKZQ13574 1117 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CERS5Q8N5B7 392 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PIGKQ92643 395 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GMIPQ9P107 970 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 IFT172Q9UG01 1749 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 A0A0X1KG70 313 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SLC22A2O15244 555 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GRB14Q14449 540 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MIOSQ9NXC5 875 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PIP5K1BO14986 540 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 STK16O75716 305 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 IFNW1P05000 195 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 RHOQP17081 205 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 AKR1D1P51857 326 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 DSC2Q02487 901 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CARTPTQ16568 116 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 OR52J3Q8NH60 311 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 NR4A1P22736 598 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PTPN9P43378 593 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ADAM17P78536 824 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PCP4L1A6NKN8 68 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 IFNA6P05013 189 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ZNF12P17014 697 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 HSPA7P48741 367 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 VBP1P61758 197 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CA9Q16790 459 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TMEM27Q9HBJ8 222 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CLDN25C9JDP6 229 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CXCR6O00574 342 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ADAMDEC1O15204 470 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SEMA3DO95025 777 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MYBPC3Q14896 1274 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 RTL4Q6ZR62 310 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 USP43Q70EL4 1123 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 FZD10Q9ULW2 581 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 FAM172BPA6NC97 362 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 PRODHO43272 600 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CHRNB2P17787 502 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 OR10H5Q8NGA6 315 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GIN1Q9NXP7 522 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MYPNQ86TC9 1320 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MATN3O15232 486 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 AP3S2P59780 193 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB6Q15916 424 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms