RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-210ENST00000588340 ATMQ13315 3056 aa6.78□□□□□ -1.32
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EFTUD2-210ENST00000588340 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 CTAGE9A4FU28 777 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC188H7C350 402 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 AGRPO00253 132 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 EML2O95834 649 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 AGTP01019 485 aa6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 ETS1P14921 441 aa6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 ITIH1P19827 911 aa6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 LIMK2P53671 638 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 XIAPP98170 497 aa6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 CLN3Q13286 438 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 OLIG2Q13516 323 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 ALS2CLQ60I27 953 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 JAMLQ86YT9 394 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 SFRP1Q8N474 314 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 PRAMEF10O60809 474 aa6.76□□□□□ -1.33
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EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 IYDQ6PHW0 289 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 PCSK4Q6UW60 755 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 XKR5Q6UX68 686 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.76□□□□□ -1.33
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