RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 SMU1Q2TAY7 513 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MMEL1Q495T6 779 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GPR33Q49SQ1 333 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MPPE1Q53F39 396 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 AGKQ53H12 422 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 REP15Q6BDI9 236 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 HTR3DQ70Z44 454 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GPSM1Q86YR5 675 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MEIOBQ8N635 442 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SCLYQ96I15 445 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LRGUKQ96M69 825 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 DEFB118Q96PH6 123 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LYSMD1Q96S90 227 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF382Q96SR6 550 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GPR21Q99679 349 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM15Q9C019 465 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GKN1Q9NS71 199 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GID8Q9NWU2 228 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 IL17CQ9P0M4 197 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 VPS51Q9UID3 782 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 APPL1Q9UKG1 709 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CROTQ9UKG9 612 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 DHRS7Q9Y394 339 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 COL4A6Q14031 1691 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 C2orf78A6NCI8 922 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 BTN3A1O00481 513 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FBP2O00757 339 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PIP5K1BO14986 540 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CFLARO15519 480 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPAN3O60637 253 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SNX2O60749 519 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CRCPO75575 148 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 BAIAP3O94812 1187 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PDHA1P08559 390 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PIRTP0C851 137 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR35P0CG20 571 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 HDCP19113 662 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MSH3P20585 1137 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ITGALP20701 1170 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RGS4P49798 205 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SGSHP51688 502 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CCL23P55773 120 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RHDQ02161 417 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TLE2Q04725 743 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 POU4F2Q12837 409 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 BNIP2Q12982 314 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MED21Q13503 144 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PEX6Q13608 980 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PTPRCAPQ14761 206 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIP10Q15642 601 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 XKR7Q5GH72 579 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms