RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ZNF711	Q9Y462	761 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	BRCA2	P51587	3418 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	LRRC53	A6NM62	1247 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CLGN	O14967	610 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CAMTA2	O94983	1202 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	LAMP2	P13473	410 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CDA	P32320	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	RFC4	P35249	363 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CASP2	P42575	452 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	GNAQ	P50148	359 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ZNF132	P52740	706 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	RAD23B	P54727	409 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	NLRP5	P59047	1200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	OLR1	P78380	273 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CCNG2	Q16589	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TMEM219	Q86XT9	240 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ADSSL1	Q8N142	457 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	NGEF	Q8N5V2	710 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	NEK9	Q8TD19	979 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TMEM19	Q96HH6	336 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TTC14	Q96N46	770 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	NODAL	Q96S42	347 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CDK19	Q9BWU1	502 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	STRA6	Q9BX79	667 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MUC13	Q9H3R2	512 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	MKLN1	Q9UL63	735 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ROCK1	Q13464	1354 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	LAMA3	Q16787	3333 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ADGRB1	O14514	1584 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084		A0A0G2JPF8	293 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	XPNPEP2	O43895	674 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PAGE4	O60829	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SPARC	P09486	303 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ACADM	P11310	421 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	S1PR1	P21453	382 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	DGKA	P23743	735 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ARL3	P36405	182 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	HUNK	P57058	714 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	FGFBP1	Q14512	234 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	KRT24	Q2M2I5	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SMARCE1	Q969G3	411 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PERP	Q96FX8	193 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PCYT2	Q99447	389 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	ABI3	Q9P2A4	366 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COX11-208	ENST00000576084	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87

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