RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CBX6O95503 412 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 JUNP05412 331 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FYNP06241 537 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 VSIG10L2P0DP72 767 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CPEP16870 476 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 TCN2P20062 427 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FBLP22087 321 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SCP2P22307 547 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RRM1P23921 792 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CD1CP29017 333 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CASP1P29466 404 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ATICP31939 592 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 NUDT1P36639 197 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FLT3P36888 993 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RABIFP47224 123 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 MASP1P48740 699 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RGS7P49802 495 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 DNA2P51530 1060 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CCL11P51671 97 aa2.99□□□□□ -1.93
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CHMP4A-208ENST00000534106 MAZP56270 477 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 TBX4P57082 545 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 PFN3P60673 137 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 PPARDQ03181 441 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SGCGQ13326 291 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CDH18Q13634 790 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 TM4SF20Q53R12 229 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RAB41Q5JT25 222 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 C1orf220Q5T0J3 134 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 MPP7Q5T2T1 576 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM46CQ5VWP2 391 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FOXB2Q5VYV0 432 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RAP1GAP2Q684P5 730 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FOXR2Q6PJQ5 311 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 UNC93AQ86WB7 457 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ADGRG3Q86Y34 549 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CMTM4Q8IZR5 234 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ARL10Q8N8L6 244 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 KDM1BQ8NB78 822 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 OR5AN1Q8NGI8 311 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RNF139Q8WU17 664 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 OR8D1Q8WZ84 308 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ST8SIA2Q92186 375 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 STARD8Q92502 1023 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 DLG3Q92796 817 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CENPTQ96BT3 561 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 HVCN1Q96D96 273 aa2.99□□□□□ -1.93
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CHMP4A-208ENST00000534106 EXOC2Q96KP1 924 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SPAG5Q96R06 1193 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RUFY1Q96T51 708 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FOXB1Q99853 325 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC13A1Q9BZW2 595 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 CDH19Q9H159 772 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 TRPS1Q9UHF7 1281 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 DNAI1Q9UI46 699 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 PILRAQ9UKJ1 303 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ENTPD4Q9Y227 616 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FADS3Q9Y5Q0 445 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SNX10Q9Y5X0 201 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 COL6A5A8TX70 2615 aa2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 LRRK1Q38SD2 2015 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 PIPSLA2A3N6 862 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 A6NL46 340 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 B4DGG1 531 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 PRSS44E7EML9 344 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 F5H423 210 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 MKRN2OSH3BPM6 223 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 STX6O43752 255 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 ZG16O60844 167 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 RASGRP1O95267 797 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 MOCS3O95396 460 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 IGLV3-27P01718 113 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 HLA-DRAP01903 254 aa2.98□□□□□ -1.93
CHMP4A-208ENST00000534106 SRCP12931 536 aa2.98□□□□□ -1.93
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