RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	GPT	P24298	496 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNA5	P30532	468 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	SHMT1	P34896	483 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	CTNNB1	P35222	781 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	PRCP	P42785	496 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	NR4A2	P43354	598 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ1	P48048	391 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	GPC3	P51654	580 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	CLCNKB	P51801	687 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TKTL1	P51854	596 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ASIC1	P78348	528 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	RBPJ	Q06330	500 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ACSM1	Q08AH1	577 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGAD	Q13349	1161 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM29	Q14134	588 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	PGM5	Q15124	567 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	SHB	Q15464	509 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	MYLK3	Q32MK0	819 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	USP41	Q3LFD5	358 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX38	Q6PEX7	206 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	RPAIN	Q86UA6	219 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB2	Q8N680	514 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL8	Q96CD0	374 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	BICD1	Q96G01	975 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	FCRL5	Q96RD9	977 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	RUFY1	Q96T51	708 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	EGFL8	Q99944	293 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TM2D2	Q9BX73	214 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM7	Q9C029	511 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	PIGM	Q9H3S5	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	HIPK3	Q9H422	1215 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	STX8	Q9UNK0	236 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	AURKC	Q9UQB9	309 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAMTS12	P58397	1594 aa		3.97	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	ACE	P12821	1306 aa		3.96	□□□□□ -1.77
FAM49B-222	ENST00000522702	MYMK	A6NI61	221 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM22	K7EJ46	135 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	VCY	O14598	125 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	ST8SIA3	O43173	380 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	VEGFD	O43915	354 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	JRK	O75564	520 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	HEXB	P07686	556 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	TFPI	P10646	304 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	PRLR	P16471	622 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	ACADL	P28330	430 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	RABIF	P47224	123 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMLG	P49069	296 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	CASP9	P55211	416 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	STARD6	P59095	220 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP2R2B	Q00005	443 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	HFE	Q30201	348 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	PLK5	Q496M5	336 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	SYTL3	Q4VX76	610 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	SHE	Q5VZ18	495 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		3.96	□□□□□ -1.78
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCK1	Q86TW2	530 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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