RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 WDR37Q9Y2I8 494 aa29.64■■■□□ 2.34
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ALYREF-202ENST00000505490 KCNJ13O60928 360 aa29.63■■■□□ 2.33
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ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP25P42331 645 aa29.6■■■□□ 2.33
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ALYREF-202ENST00000505490 SLC35G2Q8TBE7 412 aa29.6■■■□□ 2.33
ALYREF-202ENST00000505490 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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ALYREF-202ENST00000505490 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa29.57■■■□□ 2.32
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ALYREF-202ENST00000505490 CT55Q8WUE5 264 aa29.57■■■□□ 2.32
ALYREF-202ENST00000505490 PDE7BQ9NP56 450 aa29.57■■■□□ 2.32
ALYREF-202ENST00000505490 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
ALYREF-202ENST00000505490 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.326e-7■□□□□ 8.6
ALYREF-202ENST00000505490 MED13Q9UHV7 2174 aa29.56■■■□□ 2.32
ALYREF-202ENST00000505490 MTSS1O43312 755 aa29.56■■■□□ 2.32
ALYREF-202ENST00000505490 PMPCBO75439 489 aa29.56■■■□□ 2.32
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