RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GREM1O60565 184 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAFKO60675 156 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBX10O75333 385 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ECI2O75521 394 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANXA9O76027 345 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 HSPA4LO95757 839 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PRKCGP05129 697 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ERVK-10P10266 1014 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPN3P26045 913 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GDI1P31150 447 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACVRL1P37023 503 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 HADHAP40939 763 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 COPAP53621 1224 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIMK2P53671 638 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRKAA2P54646 552 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACTR3P61158 418 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ST8SIA6P61647 398 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 AP2B1P63010 937 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KDSRQ06136 332 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PDPK2PQ6A1A2 396 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 AAGABQ6PD74 315 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM135Q86UB9 458 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 C10orf107Q8IVU9 208 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCLK2Q8N568 766 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAT16Q8N8M0 369 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 FATE1Q969F0 183 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF599Q96NL3 588 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MYADMQ96S97 322 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SORT1Q99523 831 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 THTPAQ9BU02 230 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDH19Q9H159 772 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 VCXQ9H320 206 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 EBF3Q9H4W6 596 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 POMKQ9H5K3 350 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRD9Q9H8M2 597 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NT5MQ9NPB1 228 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PNPOQ9NVS9 261 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NDE1Q9NXR1 346 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEC1Q9P2X7 70 aa5.56□□□□□ -1.52
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ARHGEF3-215ENST00000498517 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC25A13Q9UJS0 675 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSAT1Q9Y617 370 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.56□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A096LPK6 155 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0D9SEW6 157 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEI4A8MW99 385 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 J3KR12 359 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MBTPS2O43462 519 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRAMEF11O60813 436 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM13O60858 407 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP12O75317 370 aa5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 HPXP02790 462 aa5.55□□□□□ -1.52
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