RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	NCSTN	Q92542	709 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PBK	Q96KB5	322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RDH14	Q9HBH5	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ACACA	Q13085	2346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF4	O00268	1085 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PPM1D	O15297	605 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KLK10	O43240	276 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	B4GAT1	O43505	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KDM1A	O60341	852 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A9	O60656	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT37	O76014	449 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL18	O95568	372 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	APRT	P07741	180 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A6	P19224	532 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A1	P22309	533 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A4	P22310	534 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A3	P35503	534 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	LIMK2	P53671	638 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB15	P59190	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAME	P78395	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CCZ1B	P86790	482 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNG1	Q06432	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PATE1	Q8WXA2	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	LILRA5	A6NI73	299 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	UBXN7	O94888	489 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPNS1	P04632	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TPH1	P17752	444 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ADRA1D	P25100	572 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFS1	P28331	727 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CD1C	P29017	333 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	NSG1	P42857	185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL4D	P49703	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP1A2	P50993	1020 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	GDF10	P55107	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	DMPK	Q09013	629 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM129C	Q86XR2	697 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TAAR9	Q96RI9	348 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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