RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492772.1

SND1-215, Transcript of staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1, human

TSL 4

Gene SND1, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SND1-215	ENST00000492772	CASS4	Q9NQ75	786 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TLCD2	A6NGC4	264 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	CEACAM4	O75871	244 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	JCHAIN	P01591	159 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	MMP2	P08253	660 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	CD48	P09326	243 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	EBLN1	P0CF75	366 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	FOLR1	P15328	257 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	FECH	P22830	423 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	IL4R	P24394	825 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	PTGIR	P43119	386 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	CCL11	P51671	97 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TUBB4B	P68371	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	LAMB3	Q13751	1172 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TUBB2A	Q13885	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	GTF2H3	Q13889	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	GALNT3	Q14435	633 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	KCNAB1	Q14722	419 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	STX1A	Q16623	288 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	OR8K5	Q8NH50	307 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	HDAC11	Q96DB2	347 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	VPS35	Q96QK1	796 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	FGF21	Q9NSA1	209 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ZNF711	Q9Y462	761 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	KCNJ13	O60928	360 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SCRG1	O75711	98 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	CDK14	O94921	469 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SLC4A1	P02730	911 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	DCT	P40126	519 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ARSE	P51690	589 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	GSDMD	P57764	484 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	PPP1CA	P62136	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	HSD11B2	P80365	405 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	PLCL1	Q15111	1095 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	PDK2	Q15119	407 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	MR1	Q95460	341 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	EID2B	Q96D98	161 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	LRFN5	Q96NI6	719 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	TRIB3	Q96RU7	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SND1-215	ENST00000492772	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	MTX2	O75431	263 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	TMEM63A	O94886	807 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	DMPK	Q09013	629 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	SLC6A19	Q695T7	634 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SND1-215	ENST00000492772	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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