RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZBTB2Q8N680 514 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CD248Q9HCU0 757 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCR7P32248 378 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 GPR1P46091 355 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ATP6V0D1P61421 351 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 IFT88Q13099 833 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TMEM237Q96Q45 408 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 VPS35Q96QK1 796 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 RNF112Q9ULX5 631 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 A0A0G2JND7 137 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SGTAO43765 313 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 DNTTP04053 509 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 OR56A5P0C7T3 313 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 MTHFD2P13995 350 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 GLULP15104 373 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CREB5Q02930 508 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 C10orf82Q8WW14 230 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 KLK6Q92876 244 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PNPOQ9NVS9 261 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 HSPA4LO95757 839 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PRKAA2P54646 552 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 AGR3Q8TD06 166 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 KCNK13Q9HB14 408 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CD93Q9NPY3 652 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CA14Q9ULX7 337 aa20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CFAP99D6REC4 459 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 F8W8V4 182 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TSPAN6O43657 245 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 AP1G1O43747 822 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 KERAO60938 352 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 SUPT3HO75486 399 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 TGDSO95455 350 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 CTSCP53634 463 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PFKFB4Q16877 469 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 PANX3Q96QZ0 392 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 NUMA1Q14980 2115 aa20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1-209ENST00000491569 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 TM7SF2O76062 418 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 DNAJB13P59910 316 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 Q6ZS52 159 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 FLCNQ8NFG4 579 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 DRC3Q9H069 523 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 TMEM114B3SHH9 223 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 SMIM24O75264 130 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 TPBGLP0DKB5 382 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 HK3P52790 923 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 DPTQ07507 201 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 DMTNQ08495 405 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 RCN2Q14257 317 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 CFAP157Q5JU67 520 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM124AQ86V42 546 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms