RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.42□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 ITM2BQ9Y287 266 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 FAM170AA1A519 330 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPAN11A1L157 253 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CPED1A4D0V7 1026 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPN8A6NHC0 703 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.4□□□□□ -1.38
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