RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489337.5

SMTN-218, Transcript of smoothelin, humanhuman

TSL 2

Gene SMTN, Length 3,560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTN-218ENST00000489337 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.65□□□□□ -0.54
SMTN-218ENST00000489337 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.65□□□□□ -0.54
SMTN-218ENST00000489337 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.65□□□□□ -0.54
SMTN-218ENST00000489337 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.65□□□□□ -0.54
SMTN-218ENST00000489337 MAGEB16A2A368 324 aa11.65□□□□□ -0.54
SMTN-218ENST00000489337 AP3B1O00203 1094 aa11.65□□□□□ -0.54
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SMTN-218ENST00000489337 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.64□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 RNF145Q96MT1 663 aa11.64□□□□□ -0.55
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SMTN-218ENST00000489337 RAB10P61026 200 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CTBP1Q13363 440 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DSC3Q14574 896 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 FUT11Q495W5 492 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PKDCCQ504Y2 493 aa11.63□□□□□ -0.55
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