RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483785.1

SPIN1-204, Transcript of spindlin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN1, Length 659 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN1-204ENST00000483785 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 CPT1BQ92523 772 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 C19orf60Q96EN9 201 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 BMFQ96LC9 184 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SMC6Q96SB8 1091 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 NPY6RQ99463 290 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SMOQ99835 787 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 EURLQ9NYK6 297 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 COPG2Q9UBF2 871 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 POLHQ9Y253 713 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ATRQ13535 2644 aa6.96□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 TLDC2A0PJX2 215 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 INPP4BO15327 924 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 LRRTM2O43300 516 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 DNAJB5O75953 348 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PCDH8O95206 1070 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SHBGP04278 402 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 GSTA1P08263 222 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 L1CAMP32004 1257 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 RABIFP47224 123 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SERPINB9P50453 376 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ART1P52961 327 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 CORO7P57737 925 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 TAS2R38P59533 333 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PRR20EP86478 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PRR20CP86479 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PRR20DP86480 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PRR20BP86481 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PRR20AP86496 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 GUCY1A3Q02108 690 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SEMA5AQ13591 1074 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ERV3-1Q14264 604 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SPARCL1Q14515 664 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 KCNJ11Q14654 390 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 KYNUQ16719 465 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 TBCELQ5QJ74 424 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 MFN1Q8IWA4 741 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 PALM2Q8IXS6 379 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 FUKQ8N0W3 1084 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 CABS1Q96KC9 395 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 MAGEB18Q96M61 343 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.35e-6■■■■□ 24.8
SPIN1-204ENST00000483785 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 LRRC61Q9BV99 259 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 DDA1Q9BW61 102 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 GPR27Q9NS67 375 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 ZNF358Q9NW07 568 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.95□□□□□ -1.3
SPIN1-204ENST00000483785 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms