RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 GLUD2P49448 558 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PFKFB4Q16877 469 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PROX1Q92786 737 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RMND5AQ9H871 391 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.07■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 G3V2T6 193 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GPIP06744 558 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MTPNP58546 118 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V0D1P61421 351 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM135Q86UB9 458 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FICDQ9BVA6 458 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 INVSQ9Y283 1065 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PGLSO95336 258 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CAPNS1P04632 268 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HMBSP08397 361 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CPB1P15086 417 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CRHBPP24387 322 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IL12AP29459 219 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FMO4P31512 558 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MAXP61244 160 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PYCR3Q53H96 274 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DESI1Q6ICB0 168 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 OR8H2Q8N162 312 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF1Q9NS23 344 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NOD1Q9Y239 953 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC159P0C7I6 412 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNB1P11230 501 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HK2P52789 917 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CDH17Q12864 832 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2H3Q13889 308 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 DAG1Q14118 895 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TTC23Q5W5X9 447 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 XAF1Q6GPH4 301 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 IL37Q9NZH6 218 aa16.06■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TOMM70O94826 608 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CST1P01037 141 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TCF3P15923 654 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 S100A5P33763 92 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 EPS8Q12929 822 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SMU1Q2TAY7 513 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NEK5Q6P3R8 708 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CYP7B1O75881 506 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TGM1P22735 817 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SLC1A2P43004 574 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CD47Q08722 323 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ADPRMQ3LIE5 342 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 GPR158Q5T848 1215 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 FAR1Q8WVX9 515 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 TTYH2Q9BSA4 534 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 BEX2Q9BXY8 128 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.05■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC154A6NI56 674 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 CENPXA8MT69 81 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NUAK1O60285 661 aa16.04■□□□□ 0.16
CCSAP-204ENST00000483092 NPHS1O60500 1241 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms