RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MATN3O15232 486 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFB5O43674 189 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 EEDO75530 441 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS23O95084 383 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CCR1P32246 355 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SEPHS1P49903 392 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 AIF1P55008 147 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRNB3Q05901 458 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 VGLL4Q14135 290 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KCTD2Q14681 263 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 LAPTM4AQ15012 233 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CRY1Q16526 586 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA5Q16718 116 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SULT1C3Q6IMI6 304 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PIK3C3Q8NEB9 887 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CALML6Q8TD86 181 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFP42Q96MM3 310 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CDK15Q96Q40 435 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SPC25Q9HBM1 224 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 VTA1Q9NP79 307 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO8Q9NRD0 319 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCB10Q9NRK6 738 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO10Q9UK96 956 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM50BQ9Y247 325 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SYCE1LA8MT33 242 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BRB1 525 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GNGT2O14610 69 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 CNMDO75829 334 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SOAT2O75908 522 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 CST1P01037 141 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 CD4P01730 458 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FGF4P08620 206 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PCMT1P22061 227 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FMO3P31513 532 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GABARAPL2P60520 117 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 IL1RL1Q01638 556 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 DSC2Q02487 901 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SEMA3AQ14563 771 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC14A2Q15849 920 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FXNQ16595 210 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SV2CQ496J9 727 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GALNT5Q7Z7M9 940 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SAPCD2Q86UD0 394 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FNDC5Q8NAU1 212 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF555Q8NEP9 628 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC3Q9BY71 257 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ERVK-18Q9QC07 812 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 IFT52Q9Y366 437 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJB5O75953 348 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 RAP2AP10114 183 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP4B1P13584 511 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 HTR1EP28566 365 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 NFKB2Q00653 900 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 NOTUMQ6P988 496 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SYVN1Q86TM6 617 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TBCDQ9BTW9 1192 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 MIA3Q5JRA6 1907 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 SNX2O60749 519 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 MITFO75030 526 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GOT2P00505 430 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ITIH1P19827 911 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 WARSP23381 471 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMB9P28065 219 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 IL5RAQ01344 420 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 EMX2Q04743 252 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 DMPKQ09013 629 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 LCP2Q13094 533 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 TTC23Q5W5X9 447 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 KDELC1Q6UW63 502 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 PROSER1Q86XN7 944 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 GPC2Q8N158 579 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 FAR1Q8WVX9 515 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 NDEL1Q9GZM8 345 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ITM2CQ9NQX7 267 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF225Q9UK10 706 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms