RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PLPP2	O43688	288 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MEP1A	Q16819	746 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DDO	Q99489	341 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MID1	O15344	667 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF217	O75362	1048 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KRT36	O76013	467 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GJA1	P17302	382 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	NR2F2	P24468	414 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	HRH2	P25021	359 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	USP8	P40818	1118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CAPZA2	P47755	286 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CLDN20	P56880	219 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	UBXN2A	P68543	259 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TROAP	Q12815	778 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	NAGS	Q8N159	534 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	FIG4	Q92562	907 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PTER	Q96BW5	349 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PTPRC	P08575	1304 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454		A0A0G2JPF8	293 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454		H0YIN7	160 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454		J3QR06	171 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	UBE2C	O00762	179 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFS4	O43181	175 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB43	O43298	467 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	BUB3	O43684	328 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LDB3	O75112	727 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	VPREB1	P12018	145 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	S1PR1	P21453	382 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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