RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 MKRN2OSH3BPM6 223 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PDK1Q15118 436 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 FAM92BQ6ZTR7 304 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 LUZP1Q86V48 1076 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 OLFM3Q96PB7 478 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 VPS35Q96QK1 796 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 RAB33BQ9H082 229 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PADI1Q9ULC6 663 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.21■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 MTSS1O43312 755 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 NDST3O95803 873 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 GP1BBP13224 206 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 MESDQ14696 234 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 SLC14A2Q15849 920 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 IRGCQ6NXR0 463 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 NPNTQ6UXI9 565 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TEX19Q8NA77 164 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TLK1Q9UKI8 766 aa22.2■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PIPSLA2A3N6 862 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CDC14CA4D256 554 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CREG1O75629 220 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TIAF1O95411 115 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 RECKO95980 971 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CASP14P31944 242 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CD97P48960 835 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PPP1CAP62136 330 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 SLC18A3Q16572 532 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 ASB18Q6ZVZ8 466 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 VSIG1Q86XK7 387 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 FAM26EQ8N5C1 309 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 GLOD4Q9HC38 313 aa22.19■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 APOL1O14791 398 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PMPCBO75439 489 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 RFPL1O75677 317 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 VCLP18206 1134 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PMS2P54278 862 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 MLLT10P55197 1068 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 DNASE1L3Q13609 305 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TEX44Q53QW1 395 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CT55Q8WUE5 264 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 SLC41A2Q96JW4 573 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 IL26Q9NPH9 171 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 LHX9Q9NQ69 397 aa22.18■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 MT-ND3P03897 115 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 FOLR1P15328 257 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 HMGCLP35914 325 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TPM4P67936 248 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 GDAP1Q8TB36 358 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PDE7BQ9NP56 450 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 UBP1Q9NZI7 540 aa22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 C21orf140B9A014 251 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 PDGFAP04085 211 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 NTRK1P04629 796 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TMEM253P0C7T8 217 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 FECHP22830 423 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 HALP42357 657 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 KCNAB1Q14722 419 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 UBXN4Q92575 508 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TEKT5Q96M29 485 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 RARRES3Q9UL19 164 aa22.16■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 KCNJ13O60928 360 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 POP7O75817 140 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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