RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 INPP4BO15327 924 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 NUAK1O60285 661 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 DFNA5O60443 496 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CDH16O75309 829 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 FUCA1P04066 466 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CEACAM5P06731 702 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ITGA2BP08514 1039 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF806P0C7X5 589 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 FDXRP22570 491 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CNTFP26441 200 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 POLD2P49005 469 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SERPINB9P50453 376 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CTSCP53634 463 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SPEM2Q0P670 501 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GBX1Q14549 363 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC6Q16204 474 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CSRP2Q16527 193 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 HDXQ7Z353 690 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM74Q86UV6 250 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 RMI1Q9H9A7 625 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 FGF22Q9HCT0 170 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GPR34Q9UPC5 381 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GVT2 93 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CFAP99D6REC4 459 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BM21 787 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BMM5 538 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TLR4O00206 839 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 QSOX1O00391 747 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGAP33O14559 1287 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 RASGRF2O14827 1237 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PFDN6O15212 129 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 YKT6O15498 198 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP8B1O43520 1251 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 MTX2O75431 263 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFS3O75489 264 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 INHBAP08476 426 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GSTM1P09488 218 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PMLP29590 882 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PI4KAP42356 2102 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 MSH2P43246 934 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCG1P45844 678 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CLCN7P51798 805 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 NXPH1P58417 271 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 BNC1Q01954 994 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GSTM4Q03013 218 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 DMPKQ09013 629 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAJC3Q13217 504 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 FZD2Q14332 565 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZSR6 202 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CROCCP2Q86T23 111 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 MTBPQ96DY7 904 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PGM2Q96G03 612 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PDXPQ96GD0 296 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR92Q96MX6 357 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PHOX2BQ99453 314 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TTC1Q99614 292 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms