RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM25AB3EWG3 89 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM25CB3EWG5 89 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM25GB3EWG6 89 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BUI4 141 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DPYSL4O14531 572 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPSAP2O60256 369 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KPNA6O60684 536 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GRAP2O75791 330 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CABYRO75952 493 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ENDOD1O94919 500 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 THRBP10828 461 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKACAP17612 351 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PCMT1P22061 227 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 EDNRBP24530 442 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP2K4P45985 399 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSFP54793 590 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTR2P61160 394 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA5AQ13591 1074 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MLC1Q15049 377 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CNSTQ6PJW8 725 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FAR1Q8WVX9 515 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RORBQ92753 470 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC120Q96HB5 630 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MID2Q9UJV3 735 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CITO14578 2027 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LTBP2Q14767 1821 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT87PA6NCN2 255 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 XPNPEP2O43895 674 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DLX3O60479 287 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ13O60928 360 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 APBB3O95704 486 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GPIP06744 558 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 POLBP06746 335 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGB6P18564 788 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 YWHAQP27348 245 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMB9P28065 219 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GRK3P35626 688 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CD47Q08722 323 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 XYLT1Q86Y38 959 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC185Q8N715 623 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NETO2Q8NC67 525 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BEST2Q8NFU1 509 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF145Q96MT1 663 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TOR3AQ9H497 397 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG2Q9H553 416 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CMTM6Q9NX76 183 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 XPR1Q9UBH6 696 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TLK1Q9UKI8 766 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SOAT2O75908 522 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 APOA1P02647 267 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RBP1P09455 135 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTM1P09488 218 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TGM2P21980 687 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CBLP22681 906 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HTRA3P83110 453 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SQSTM1Q13501 440 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CA9Q16790 459 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DLK2Q6UY11 383 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms