RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 HUNKP57058 714 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 IL2P60568 153 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CTBSQ01459 385 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SEMA3AQ14563 771 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 RABL3Q5HYI8 236 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PAGE3Q5JUK9 113 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 GPR107Q5VW38 600 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 GLYATQ6IB77 296 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 GPSM1Q86YR5 675 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SNX31Q8N9S9 440 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 HSPBAP1Q96EW2 488 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHA8Q96JA3 519 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PSKH2Q96QS6 385 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 BTRCQ9Y297 605 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF711Q9Y462 761 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 KCTD3Q9Y597 815 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.67■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SYN3O14994 580 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D4O60343 1298 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TPST1O60507 370 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 BCL10O95999 233 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CHRNA1P02708 482 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 KCNC4Q03721 635 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SMARCB1Q12824 385 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 FAM9CQ8IZT9 166 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ITFG1Q8TB96 612 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ACDQ96AP0 544 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 VPS33AQ96AX1 596 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 KCNA7Q96RP8 456 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ZBTB18Q99592 522 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CGREF1Q99674 301 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ING2Q9H160 280 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 MED16Q9Y2X0 877 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ARL5AQ9Y689 179 aa16.66■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 CNTN5O94779 1100 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 WDR47O94967 919 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SNAP29O95721 258 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 UGT1A6P19224 532 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PTGER3P43115 390 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 UFM1P61960 85 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 RBBP7Q16576 425 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TTC23LQ6PF05 361 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 GIPC3Q8TF64 312 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 RNF145Q96MT1 663 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.65■□□□□ 0.26
HCLS1-202ENST00000428394 OR6C75A6NL08 312 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 UPK1AO00322 258 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 BTN3A1O00481 513 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 E2F3O00716 465 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 PPP6CO00743 305 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 CLPXO76031 633 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 KCNH1O95259 989 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 TSPAN12O95859 305 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 OTCP00480 354 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 RETP07949 1114 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 CHRM3P20309 590 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 OR1E1P30953 314 aa16.64■□□□□ 0.25
HCLS1-202ENST00000428394 BEX3Q00994 111 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms