RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRABD2AQ86V40 505 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP4X1Q8N118 509 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MPP5Q8N3R9 675 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MZB1Q8WU39 189 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTPRN2Q92932 1015 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC17Q96AE7 1141 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BOCQ9BWV1 1114 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDFQ9HBH1 243 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PADI4Q9UM07 663 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.48□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTORP42345 2549 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PQM1 296 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PQU0 124 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STMND1H3BQB6 276 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 J3KR12 359 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBL1XO60907 577 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LDLRP01130 860 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSF2P04141 144 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HLA-DQB2P05538 268 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MGAT1P26572 445 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKT2P31751 481 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCKBRP32239 447 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MSH2P43246 934 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP1A2P50993 1020 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GNA12Q03113 381 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNTN1Q12860 1018 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDH17Q12864 832 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MPP3Q13368 585 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf61Q13536 156 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MARC1Q5VT66 337 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KDELC1Q6UW63 502 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RANBP10Q6VN20 620 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM135Q86UB9 458 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLMNQ92990 594 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM74Q96NL1 305 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAFAH2Q99487 392 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL22Q9GZX6 179 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BFARQ9NZS9 450 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GULP1Q9UBP9 304 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SARDHQ9UL12 918 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED13LQ71F56 2210 aa9.47□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ESPL1Q14674 2120 aa9.46□□□□□ -0.89
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BM21 787 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPP1O14773 563 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KDELR3O43731 214 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USP1O94782 785 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ASLP04424 464 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLBP06746 335 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JUNDP17535 347 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD82P27701 267 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACVRL1P37023 503 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETFBP38117 255 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUMBP49757 651 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAS2R38P59533 333 aa9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms