RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 SNX31Q8N9S9 440 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 HM13Q8TCT9 377 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 TMEM125Q96AQ2 219 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 SLC39A3Q9BRY0 314 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 RNF11Q9Y3C5 154 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-205ENST00000409985 FAM234BA2RU67 622 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZNF839A8K0R7 811 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 FZD6O60353 706 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A3O75751 556 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 H6PDO95479 791 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PRKCQQ04759 706 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CACNG1Q06432 222 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 NADK2Q4G0N4 442 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 NHSL2Q5HYW2 709 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 APPL1Q9UKG1 709 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 BTRCQ9Y297 605 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 DHRS7Q9Y394 339 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ST14Q9Y5Y6 855 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CBX4O00257 560 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 E2F3O00716 465 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 VILLO15195 856 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CSPG5O95196 566 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ARF5P84085 180 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 NRF1Q16656 503 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 IYDQ6PHW0 289 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TRPV3Q8NET8 790 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 LINGO1Q96FE5 620 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SLC29A1Q99808 456 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 IL17CQ9P0M4 197 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZNF225Q9UK10 706 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGB4Q9UN71 923 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 AKAP10O43572 662 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CD160O95971 181 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 FASP25445 335 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TRAF2Q12933 501 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TBCELQ5QJ74 424 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 RNF165Q6ZSG1 346 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GALNT13Q8IUC8 556 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 LRRC43Q8N309 656 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 DPP10Q8N608 796 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TFAP2CQ92754 450 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SLC30A3Q99726 388 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZNF711Q9Y462 761 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GTL3 188 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TIPRLO75663 272 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TMCC1O94876 653 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 LINC00271P0C7V0 271 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZNF23P17027 643 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
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PMS1-205ENST00000409985 NFYCQ13952 458 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TPGS2Q68CL5 300 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 AMIGO2Q86SJ2 522 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 METTL25Q8N6Q8 603 aa23.49■■□□□ 1.35
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PMS1-205ENST00000409985 EXOC2Q96KP1 924 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CIB1Q99828 191 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 MUC3BQ9H195 1237 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CD274Q9NZQ7 290 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GALPQ9UBC7 116 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 LHX3Q9UBR4 397 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GIMAP2Q9UG22 337 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SUN2Q9UH99 717 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 MYRFQ9Y2G1 1151 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PKP3Q9Y446 797 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CCDC154A6NI56 674 aa23.49■■□□□ 1.35
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