RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 UFM1P61960 85 aa22.83■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 LHX8Q68G74 356 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 OR2T11Q8NH01 316 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF711Q9Y462 761 aa22.83■■□□□ 1.25
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF23P17027 643 aa22.83■■□□□ 1.24
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RABGGTA-202ENST00000399409 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.82■■□□□ 1.24
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RABGGTA-202ENST00000399409 OLAHQ9NV23 265 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-202ENST00000399409 H0Y626 953 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-202ENST00000399409 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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RABGGTA-202ENST00000399409 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
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RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.8■■□□□ 1.24
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RABGGTA-202ENST00000399409 TBL1XO60907 577 aa22.79■■□□□ 1.24
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RABGGTA-202ENST00000399409 ALDH3B2P48448 385 aa22.79■■□□□ 1.24
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