RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF485Q8NCK3 441 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 HCAR2Q8TDS4 363 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUDCD1Q96RS6 583 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 GFRA4Q9GZZ7 299 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAD21L1Q9H4I0 556 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 YIPF1Q9Y548 306 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLOD2O00469 737 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP2K7O14733 419 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 WISP2O76076 250 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLEC3BP05452 202 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD48P09326 243 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF883P0CG24 379 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM11P17152 192 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 HRH2P25021 359 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 MSH2P43246 934 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMTC2Q8N394 836 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAXEQ8NCW5 288 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL17REQ8NFR9 667 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRR1Q96L50 414 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTMR6Q9Y217 621 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNED1Q8TER0 1413 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 J3QR06 171 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMD14O00487 310 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF217O75362 1048 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVK-10P10266 1014 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPHA2P29317 976 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXC8P31273 242 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP2K2P36507 400 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 NR2C2P49116 596 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 GNB1P62873 340 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE2V1Q13404 147 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 FCN2Q15485 313 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEP1AQ16819 746 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALFQ53S48 1182 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF790Q6PG37 636 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTOV1Q86YD1 416 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 HACE1Q8IYU2 909 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM58Q8NG06 486 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf74Q96LT6 269 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLX1AQ9BQ83 275 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGAP2Q9UHJ9 254 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACAD8Q9UKU7 415 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 FLT1P17948 1338 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1B0GU03 582 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 A6NL46 340 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 NR5A2O00482 541 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 OGG1O15527 345 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMCC2O75069 709 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM63AO94886 807 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSHBP01222 138 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 RARGP13631 454 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAF6P49848 677 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMTC3Q6ZXV5 915 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR20Q8TBZ3 569 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 UCMAQ8WVF2 138 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 POMGNT1Q8WZA1 660 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEMA4DQ92854 862 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELMOD3Q96FG2 381 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPM1MQ96MI6 270 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 GFI1Q99684 422 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-38P-201ENST00000384085 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms