RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 TMIGD2Q96BF3 282 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 C3orf49Q96BT1 292 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 TPRKBQ9Y3C4 175 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 WEE2P0C1S8 567 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CLCQ05315 142 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 TMEM199Q8N511 208 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ACTRT1Q8TDG2 376 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 PRPSAP2O60256 369 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 TOR2AQ5JU69 321 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CMTM3Q96MX0 182 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 PCDHGB4Q9UN71 923 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 DUSP12Q9UNI6 340 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 FRMPD4Q14CM0 1322 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ALS2Q96Q42 1657 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CCNB2O95067 398 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 S100A8P05109 93 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ASGR1P07306 291 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 GNA15P30679 374 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 POU4F3Q15319 338 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 SNAPC1Q16533 368 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 HPS6Q86YV9 775 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 NRG4Q8WWG1 115 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 LINGO1Q96FE5 620 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ACTR6Q9GZN1 396 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 NMUR2Q9GZQ4 415 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 GHITMQ9H3K2 345 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CREBZFQ9NS37 354 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CEPT1Q9Y6K0 416 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 POM121BA6NF01 834 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 OGTO15294 1046 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 NRP2O60462 931 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 STX11O75558 287 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ALDH2P05091 517 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 HMBSP08397 361 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ADRA1DP25100 572 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 Q5PR19 223 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 GRTP1Q5TC63 336 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 RFX6Q8HWS3 928 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 OR2L5Q8NG80 312 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 Q96MT0 163 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 SRRDQ9UH36 339 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 GLI3P10071 1580 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CDC7O00311 574 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 THP07101 528 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ZNF35P13682 527 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CXCR2P25025 360 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 DIO1P49895 249 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 KCNK10P57789 538 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 PYDC2Q56P42 97 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 AGAP6Q5VW22 663 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 C11orf88Q6PI97 169 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 CCDC74AQ96AQ1 378 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 AGAP4Q96P64 663 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 S100A13Q99584 98 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 PI4K2AQ9BTU6 479 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 DNMT3LQ9UJW3 386 aa13.59□□□□□ -0.23
CTIF-202ENST00000382998 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 SLITRK3O94933 977 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 URODP06132 367 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 FCGR1AP12314 374 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 SAT1P21673 171 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 CASP3P42574 277 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 GATMP50440 423 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 SLC3A1Q07837 685 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 FGFBP1Q14512 234 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 TRAM2Q15035 370 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 KCNA10Q16322 511 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 ECM1Q16610 540 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 LRRC55Q6ZSA7 311 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 TMEM151BQ8IW70 566 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 AZIN2Q96A70 460 aa13.58□□□□□ -0.24
CTIF-202ENST00000382998 SPON2Q9BUD6 331 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms