RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 A0A1W2PQU0 124 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 STARD6P59095 220 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 KBTBD6Q86V97 674 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 INPP5DQ92835 1189 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 PTERQ96BW5 349 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 MID2Q9UJV3 735 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 OR2AG2A6NM03 316 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 RBP1P09455 135 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 DRD4P21917 467 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 WSCD2Q2TBF2 565 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TMEM31Q5JXX7 168 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 ZYG11AQ6WRX3 759 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 ISCA2Q86U28 154 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TRIM42Q8IWZ5 723 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 RDH11Q8TC12 318 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 PANX3Q96QZ0 392 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 DERL2Q9GZP9 239 aa26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 LRRK1Q38SD2 2015 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TARM1B6A8C7 271 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TRIOO75962 3097 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TPMTP51580 245 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 DGKEP52429 567 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 SGCGQ13326 291 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 FZD5Q13467 585 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 FGL2Q14314 439 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 OTOAQ7RTW8 1153 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 NLRP8Q86W28 1048 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 ZBTB2Q8N680 514 aa26.46■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 TSPAN12O95859 305 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 FAM107AO95990 144 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 GAS6Q14393 721 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 CES4AQ5XG92 561 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 PNCKQ6P2M8 343 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 SYT13Q7L8C5 426 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 KCTD5Q9NXV2 234 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 IKZF3Q9UKT9 509 aa26.45■■□□□ 1.83
MSX1-201ENST00000382723 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.45■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 STK25O00506 426 aa26.45■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 NDUFAB1O14561 156 aa26.45■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 KCNC1P48547 511 aa26.45■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 PREBQ9HCU5 417 aa26.45■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 SGTAO43765 313 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 C7P10643 843 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 OR4D1Q15615 310 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 TMEM259Q4ZIN3 620 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 ATG16L1Q676U5 607 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 ANO7Q6IWH7 933 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 EXT2Q93063 718 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 SLC17A9Q9BYT1 436 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 PITPNM3Q9BZ71 974 aa26.44■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 CDC7O00311 574 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 BTN3A1O00481 513 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 DLX3O60479 287 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 MAGEC1O60732 1142 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 AP2A2O94973 939 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 CCR7P32248 378 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 ACSL1P33121 698 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 CTSCP53634 463 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 ATP6V0D1P61421 351 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 PPP2CBP62714 309 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 PPP2CAP67775 309 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 BST1Q10588 318 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 HORMAD1Q86X24 394 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 OR2AG1Q9H205 316 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 OXSMQ9NWU1 459 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 EBF1Q9UH73 591 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 NEMP2A6NFY4 417 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 STX3Q13277 289 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 AGERQ15109 404 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 IRF4Q15306 451 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 ACSBG2Q5FVE4 666 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 HEATR4Q86WZ0 1026 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 HIC2Q96JB3 615 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 HHIPQ96QV1 700 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 TSSK1BQ9BXA7 367 aa26.43■■□□□ 1.82
MSX1-201ENST00000382723 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms