RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSPB3Q12988 150 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ODF2Q5BJF6 829 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ALS2CLQ60I27 953 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C18orf63Q68DL7 685 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF534Q76KX8 674 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FIBINQ8TAL6 211 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LPAR1Q92633 364 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ERO1AQ96HE7 468 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 INTS14Q96SY0 518 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KXD1Q9BQD3 176 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FZD8Q9H461 694 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BICDL2A1A5D9 508 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BECN2A8MW95 431 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TO15178 435 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SSX4O60224 188 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NUDT3O95989 172 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GBAP04062 536 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CYP1A2P05177 515 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DANCRP0C864 163 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SRCP12931 536 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CYP11B2P19099 503 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KCNA5P22460 613 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HNF4AP41235 474 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ENTPD1P49961 510 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LIMK1P53667 647 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDK3Q00526 305 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MEP1BQ16820 701 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C6orf136Q5SQH8 315 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MANEAQ5SRI9 462 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 Q6ZTK2 550 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EXD1Q8NHP7 514 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EXT2Q93063 718 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SPSB1Q96BD6 273 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR6C1Q96RD1 312 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EGFL8Q99944 293 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FUT8Q9BYC5 575 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 COX11Q9Y6N1 276 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGSF1Q8N6C5 1336 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 B8ZZF3 427 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 H0YGN5 161 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLK4O00444 970 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SOCS6O14544 535 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTGESO14684 152 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC16A5O15375 505 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZBTB43O43298 467 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADRA2CP18825 462 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNFRSF1BP20333 461 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ITGB8P26012 769 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MXI1P50539 228 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF75DP51815 510 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NUDT6P53370 316 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZXDAP98168 799 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GAGE2BQ13066 116 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTGR1Q14914 329 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CTF1Q16619 201 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AMZ1Q400G9 498 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GAGE2EQ4V326 116 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1339P-201ENST00000363574 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms