RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302313.9

WDR48-201, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR48, Length 3,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-201ENST00000302313 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 HES2Q9Y543 173 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 A0A087X1B8 175 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MYADML2A6NDP7 307 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 AQP12BA6NM10 295 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 A8MX80 341 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 H3BUI4 141 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TREHO43280 583 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CSPG5O95196 566 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PCMT1P22061 227 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NME5P56597 212 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CDC42EP1Q00587 391 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NME3Q13232 169 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 BFSP2Q13515 415 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC14A2Q15849 920 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 UGP2Q16851 508 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PARP15Q460N3 678 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FBXO43Q4G163 708 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CES3Q6UWW8 571 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FAM47BQ8NA70 645 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FIG4Q92562 907 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 LPGAT1Q92604 370 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 COQ7Q99807 217 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TASP1Q9H6P5 420 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ACOT9Q9Y305 439 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SOCS2O14508 198 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NEMP1O14524 444 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 AXIN1O15169 862 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SNX4O95219 450 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 HMGN1P05114 100 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 EVI2BP34910 448 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NOS2P35228 1153 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC9A3P48764 834 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NAGLUP54802 743 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CCL23P55773 120 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PRAMEP78395 509 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CLCQ05315 142 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MTX3Q5HYI7 312 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MUL1Q969V5 352 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MFSD3Q96ES6 412 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MTRRQ9UBK8 725 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TAF4O00268 1085 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PCNAP12004 261 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CCR10P46092 362 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 RAB10P61026 200 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 MPP1Q00013 466 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 RALGDSQ12967 914 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SP140Q13342 867 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TOR2AQ5JU69 321 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 DPH6Q7L8W6 267 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FAM124AQ86V42 546 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SCML4Q8N228 414 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 OR2T3Q8NH03 318 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CCDC126Q96EE4 140 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 TLK1Q9UKI8 766 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 Q9Y3F1 56 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 H0YC42 278 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-201ENST00000302313 SNPHO15079 494 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms