RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NDST4Q9H3R1 872 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 NOD2Q9HC29 1040 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SIX2Q9NPC8 291 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 OGFRQ9NZT2 677 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 F8P00451 2351 aa7.71□□□□□ -1.17
PGGT1B-201ENST00000296642 FBN2P35556 2912 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 F8VZ95 297 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BRJ5 948 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 BIN1O00499 593 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC172P0C7W6 258 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 EBLN1P0CF75 366 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FOLR1P15328 257 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 UCHL3P15374 230 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CD1EP15812 388 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2A7P20853 494 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 OTX2P32243 289 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC19A1P41440 591 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 HCAR3P49019 387 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP6P55212 293 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 APBA1Q02410 837 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF2Q12933 501 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RAPSNQ13702 412 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1A4Q13733 1029 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR18Q14330 331 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SSPNQ14714 243 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ASIC2Q16515 512 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2A13Q16696 494 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB6CQ53S08 254 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RPTNQ6XPR3 784 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FJX1Q86VR8 437 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNMB4Q86W47 210 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 DSELQ8IZU8 1212 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 D2HGDHQ8N465 521 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC25Q96NG3 672 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS16Q9H269 839 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQJ5 194 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM170AA1A519 330 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MATN2O00339 956 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE2BO14633 110 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TIAF1O95411 115 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 STSP08842 583 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 MYBL2P10244 700 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1A3P13637 1013 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FECHP22830 423 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA2P25787 234 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 FOLR3P41439 243 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINT3P49223 89 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 RBPJQ06330 500 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC16Q13042 620 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GPS2Q13227 327 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 NCF4Q15080 339 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 LLGL1Q15334 1064 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR1Q15399 786 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 SYTL1Q8IYJ3 562 aa7.7□□□□□ -1.18
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR135Q8IZ08 494 aa7.7□□□□□ -1.18
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