RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293880.9

SSRP1-202, Transcript of structure specific recognition protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SSRP1, Length 6,296 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1-202ENST00000293880 SEC13P55735 322 aa16■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 AMPD2Q01433 879 aa16■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 E2F2Q14209 437 aa16■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 RASSF5Q8WWW0 418 aa16■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CDT1Q9H211 546 aa16■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 FBXW2Q9UKT8 454 aa16■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SEPT4O43236 478 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PSMD10O75832 226 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 FCER2P06734 321 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 AKR1A1P14550 325 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SSR2P43308 183 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SNX33Q8WV41 574 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 LMLNQ96KR4 655 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 I3L521 148 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CCL16O15467 120 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CD52P31358 61 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GIN1Q9NXP7 522 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ALAS2P22557 587 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PSMD8P48556 350 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 BICRALQ6AI39 1079 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 IL31RAQ8NI17 732 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ASAH2Q9NR71 780 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 RAB26Q9ULW5 256 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CLUHO75153 1309 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GDI2P50395 445 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 WNT3AP56704 352 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 IRF9Q00978 393 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GRIK5Q16478 980 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SNTG1Q9NSN8 517 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF536O15090 1300 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ANGPTL1O95841 491 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 HSPA7P48741 367 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ECT2LQ008S8 904 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GTF2H2Q13888 395 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF398Q8TD17 642 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 C5orf34Q96MH7 638 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 EDARQ9UNE0 448 aa15.99■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 WNT7AO00755 349 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SKP1P63208 163 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CDK18Q07002 472 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 DDR1Q08345 913 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SP140Q13342 867 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 FAM83AQ86UY5 434 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 AP2M1Q96CW1 435 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 HAVCR1Q96D42 359 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 LYNP07948 512 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CCNFP41002 786 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CBX5P45973 191 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 XYLT1Q86Y38 959 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 LNX2Q8N448 690 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 UBR7Q8N806 425 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ALG3Q92685 438 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GNAO1P09471 354 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 FOSL1P15407 271 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 PRKCIP41743 596 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GTF2BQ00403 316 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 CD83Q01151 205 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 MTA1Q13330 715 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 SLC51AQ86UW1 340 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.98■□□□□ 0.15
SSRP1-202ENST00000293880 GPR21Q99679 349 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms