RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 NDUFB5O43674 189 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PLOD3O60568 738 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 HNF4AP41235 474 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TLK2Q86UE8 772 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ADAM2Q99965 735 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 BEX2Q9BXY8 128 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 EBPLQ9BY08 206 aa15.56■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 E9PAM4 449 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PYDC2Q56P42 97 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 MZB1Q8WU39 189 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 KLRG1Q96E93 195 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SERPINI2O75830 405 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PHKG1Q16816 387 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PPP3R2Q96LZ3 170 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CXCR6O00574 342 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ALOX5P09917 674 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 GRK4P32298 578 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SPIBQ01892 262 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 KCNAB2Q13303 367 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 HERC3Q15034 1050 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 KDM1BQ8NB78 822 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 STON2Q8WXE9 905 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PYCR2Q96C36 320 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa15.55■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 MATN3O15232 486 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 KPNA6O60684 536 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TYMPP19971 482 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 KCNA5P22460 613 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 OXTRP30559 389 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PRKAG1P54619 331 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CASP12Q6UXS9 341 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 DENND1CQ8IV53 801 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 LRCH3Q96II8 777 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 HAPLN3Q96S86 360 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 KLHL1Q9NR64 748 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF221Q9UK13 617 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CCRL2O00421 344 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 C22orf31O95567 290 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CKMP06732 381 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ARSFP54793 590 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TUBA4AP68366 448 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 IL18R1Q13478 541 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 GALNT10Q86SR1 603 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 GANCQ8TET4 914 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RSPH1Q8WYR4 309 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 FOPNLQ96NB1 174 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CD320Q9NPF0 282 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RAB23Q9ULC3 237 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 NME4O00746 187 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 MYL12BO14950 172 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 AXIN1O15169 862 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TSPAN19P0C672 248 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 HERVK_113P63132 956 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 FPGSQ05932 587 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 LIX1Q8N485 282 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RNFT2Q96EX2 444 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 LRRC3Q9BY71 257 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 OTCP00480 354 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 RAP2AP10114 183 aa15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 G6PDP11413 515 aa15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms