RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282999.7

SRP19-201, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRP19, Length 937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-201ENST00000282999 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 HES6Q96HZ4 224 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TAAR9Q96RI9 348 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 POT1Q9NUX5 634 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 LAMA5O15230 3695 aa15.95■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 C9orf172C9J069 976 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 AGRPO00253 132 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 BUD23O43709 281 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 KRT86O43790 486 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 PRAMEF1O95521 474 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CRTAMO95727 393 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 VIPP01282 170 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CCL4P13236 92 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 GPRC6AQ5T6X5 926 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 NCSTNQ92542 709 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 DDA1Q9BW61 102 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TMEM9Q9P0T7 183 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ARL5AQ9Y689 179 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CACNA1GO43497 2377 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.94■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 KLHL33A6NCF5 533 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 B4E171 279 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A9O60656 530 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A6P19224 532 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A1P22309 533 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A4P22310 534 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A3P35503 534 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TSPAN7P41732 249 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 HALP42357 657 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 RAB15P59190 212 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 DMPKQ09013 629 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 PARP6Q2NL67 630 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 P3H1Q32P28 736 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 AMZ2Q86W34 360 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ZNF398Q8TD17 642 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 APOL2Q9BQE5 337 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 A0A0U1RQJ8 604 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 STMND1H3BQB6 276 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 MSH3P20585 1137 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 MPSTP25325 297 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 AKT1P31749 480 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 HADHAP40939 763 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SLC19A1P41440 591 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 MAPK9P45984 424 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 DTX1Q86Y01 620 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SLC35B2Q8TB61 432 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ART4Q93070 314 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 WBP1Q96G27 269 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 SLC39A1Q9NY26 324 aa15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SRP19-201ENST00000282999 BPTFQ12830 3046 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms