RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274711.6

LRRTM2-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM2, Length 6,017 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2-201ENST00000274711 GRIA1P42261 906 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALDH3B1P43353 468 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC15A1P46059 708 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CDH12P55289 794 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GIT2Q14161 759 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ACBD4Q8NC06 268 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LRRN4CLQ8ND94 238 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 STK35Q8TDR2 534 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LENG9Q96B70 501 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 C14orf105Q9NVL8 296 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SLAIN2Q9P270 581 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CFL2Q9Y281 166 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 A0A087X0B3 334 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TSTD3H0UI37 97 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 HOXA2O43364 376 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 OIP5O43482 229 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 C21orf2O43822 256 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SCELO95171 688 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CYP3A5P20815 502 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CPN2P22792 545 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PSMB4P28070 264 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ICAM3P32942 547 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CD86P42081 329 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALDH3B2P48448 385 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CTBP2P56545 445 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ADIGQ0VDE8 80 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MOGSQ13724 837 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PON3Q15166 354 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TSGA10IPQ3SY00 556 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 UBXN11Q5T124 520 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CHSY3Q70JA7 882 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CUZD1Q86UP6 607 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CREG2Q8IUH2 290 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 C7orf61Q8IZ16 206 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MTURNQ8N3F0 131 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LPGAT1Q92604 370 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MTMR8Q96EF0 704 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 OR14A2Q96R54 314 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 UCK2Q9BZX2 261 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 BRD9Q9H8M2 597 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 KCNH7Q9NS40 1196 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CHST7Q9NS84 486 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SSUH2Q9Y2M2 353 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 DUOX2Q9NRD8 1548 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PTCH1Q13635 1447 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 ARID1AO14497 2285 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 A0A0A0MRY4 1105 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 ISM1B1AKI9 464 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM86B1E9PN63 330 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 MAP2K7O14733 419 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 ENTPD6O75354 484 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 NME6O75414 186 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 MICAL2O94851 1124 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 GPIP06744 558 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 CSF1RP07333 972 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRTM2-201ENST00000274711 CYP3A4P08684 503 aa3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms