RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC7BQ86TV6 843 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TERB1Q8NA31 727 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 PCED1BQ96HM7 432 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINB11Q96P15 392 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP3Q96P47 875 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FCRL5Q96RD9 977 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 THTPAQ9BU02 230 aa7.01□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMCX1Q9P291 453 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SCOCQ9UIL1 159 aa7.01□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 WASH3PC4AMC7 463 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 F5H423 210 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DFFAO00273 331 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNG3O60359 315 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SIN3BO75182 1162 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ENTPD5O75356 428 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BEST1O76090 585 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LRIG2O94898 1065 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FYNP06241 537 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C2P06681 752 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BDNFP23560 247 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CALRP27797 417 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GRIK1P39086 918 aa7□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 CD151P48509 253 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IDH3AP50213 366 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SESN3P58005 492 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTR3P61158 418 aa7□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 MAPRE2Q15555 327 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KLC3Q6P597 504 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RFWD3Q6PCD5 774 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 EPGNQ6UW88 154 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC14AQ86T13 490 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM124AQ86V42 546 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GATAD2AQ86YP4 633 aa7□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 TREML1Q86YW5 311 aa7□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 VPS39Q96JC1 886 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF570Q96NI8 536 aa7□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 GPR22Q99680 433 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FSD1LQ9BXM9 530 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP41Q9BYV8 373 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO44Q9H4M3 255 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 OXSMQ9NWU1 459 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM216Q9P0N5 145 aa7□□□□□ -1.29
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