RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261349.8

LRP6-201, Transcript of LDL receptor related protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP6, Length 10,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6-201ENST00000261349 EFNA5P52803 228 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 RPL38P63173 70 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 AMHR2Q16671 573 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 GPAT3Q53EU6 434 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 BICRALQ6AI39 1079 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CASP12Q6UXS9 341 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SPARTQ8N0X7 666 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 UXS1Q8NBZ7 420 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 GPRASP2Q96D09 838 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CPXM1Q96SM3 734 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SP110Q9HB58 689 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 AKT3Q9Y243 479 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CXCR6O00574 342 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FABP3P05413 133 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PRIM2P49643 509 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZNF81P51508 661 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 P2RX3P56373 397 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TGFB2P61812 414 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OLIG2Q13516 323 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FCGR1BQ92637 280 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MYOCQ99972 504 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CRISPLD1Q9H336 500 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SETD4Q9NVD3 440 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 C5orf58C9J3I9 102 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NPHS1O60500 1241 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 IMPDH1P20839 514 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ARNTP27540 789 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MVKQ03426 396 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ACOX1Q15067 660 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FBXO48Q5FWF7 155 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TESCQ96BS2 214 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZNF341Q9BYN7 854 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 E9PAM4 449 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SCELO95171 688 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SLC1A2P43004 574 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SLC26A2P50443 739 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NUDT6P53370 316 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PGGT1BP53609 377 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SLC6A3Q01959 620 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MAB21L1Q13394 359 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ALFQ53S48 1182 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TREML2Q5T2D2 321 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 IKBIPQ70UQ0 350 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ACOT1Q86TX2 421 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MFSD3Q96ES6 412 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 DPY30Q9C005 99 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 AASSQ9UDR5 926 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 F8W810 466 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OR2B3O76000 313 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PLATP00750 562 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 RARRES1P49788 294 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 RHBDL3P58872 404 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PRKG2Q13237 762 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 BCL2A1Q16548 175 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OR8K3Q8NH51 312 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZNF384Q8TF68 577 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 AFG1LQ8WV93 481 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PEX13Q92968 403 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.79□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 DNAJC11Q9NVH1 559 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms