RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CDRT15Q96T59 188 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 OLFM1Q99784 485 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DERL2Q9GZP9 239 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 WDR41Q9HAD4 459 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 POLG2Q9UHN1 485 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa10.52□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZMPSTE24O75844 475 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PDE5AO76074 875 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 F11P03951 625 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NAT2P11245 290 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ME2P23368 584 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TRAF2Q12933 501 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TSNQ15631 228 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CARD16Q5EG05 197 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CPXM2Q8N436 756 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MARK4Q96L34 752 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NUDT4Q9NZJ9 180 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 DEC1Q9P2X7 70 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 OPTCQ9UBM4 332 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 QSOX1O00391 747 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NR5A2O00482 541 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MRASO14807 208 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 FDXRP22570 491 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 BLVRAP53004 296 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SLC7A9P82251 487 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ECT2LQ008S8 904 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LMAN2Q12907 356 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC26Q2I0M4 334 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HTR3DQ70Z44 454 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1191Q96A73 305 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 C19orf60Q96EN9 201 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CROTQ9UKG9 612 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KATNA1O75449 491 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ALPIP09923 528 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 VCLP18206 1134 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CYP2A7P20853 494 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 GABRB3P28472 473 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 BMPR1AP36894 532 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CLCQ05315 142 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 C5orf22Q49AR2 442 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 RHEBL1Q8TAI7 183 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 FIBINQ8TAL6 211 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 RIN3Q8TB24 985 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 COQ7Q99807 217 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC106Q9BWC9 280 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ACTL7AQ9Y615 435 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF318Q5VUA4 2279 aa10.51□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ANXA5P08758 320 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ITGB8P26012 769 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TEAD2Q15562 447 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TRIP10Q15642 601 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CRY1Q16526 586 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PRMT9Q6P2P2 845 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 PHACTR4Q8IZ21 702 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TDHQ8IZJ6 230 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 KCNJ9Q92806 393 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 RCN3Q96D15 328 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 OTUB2Q96DC9 234 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 OR52B2Q96RD2 323 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NEU3Q9UQ49 428 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 AURKAO14965 403 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MUSKO15146 869 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ACADSP16219 412 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NR6A1Q15406 480 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 MYLK3Q32MK0 819 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 NAPRTQ6XQN6 538 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.5□□□□□ -0.73
PRRX1-201ENST00000239461 ACVR1CQ8NER5 493 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms