RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pkp3Q9QY23 797 aa13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SelenovD3YXG1 328 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acbd4E9Q289 327 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Alkal1J3QPP8 127 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 E2f3O35261 457 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 JundP15066 341 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vps26aP40336 327 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hsd11b2P51661 386 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dusp2Q05922 318 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PepdQ11136 493 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CenplQ3U3S3 329 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnks2Q3UES3 1166 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Taf1cQ6PDZ2 836 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NlnQ91YP2 704 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mlf2Q99KX1 247 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gimap3Q99MI6 301 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube4bQ9ES00 1173 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pin1Q9QUR7 165 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ak1Q9R0Y5 194 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam131cA2ADB2 273 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ttc23lA6H6E9 458 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem215A7E1Z1 235 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyr61P18406 379 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TgfbiP82198 683 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc22a23Q3UHH2 689 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BegainQ68EF6 600 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q6PAC4 1279 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam83eQ80XS7 481 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Itln1bQ80ZA0 313 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Snx32Q80ZJ7 404 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf689Q8BKK5 500 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9D5Y0 588 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C1qtnf3Q9ES30 246 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcne5Q9QZ26 143 aa13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col4a6B1AVK5 1691 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Alox8O35936 677 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Etv2P41163 335 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrrc3P59034 257 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxd13P70217 339 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Foxk2Q3UCQ1 651 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdp2Q504M2 532 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcna5Q61762 602 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arhgap30Q640N3 1101 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Snx31Q6P8Y7 439 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp8Q80U87 1080 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nat14Q8BVG8 206 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TbcelQ8C5W3 424 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr448Q8VES9 310 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Taf11Q99JX1 211 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wars2Q9CYK1 360 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dhx34Q9DBV3 1145 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nectin1Q9JKF6 515 aa13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A286YCD0 109 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ceacam3E9Q6J4 706 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm43302L7N1X8 611 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Neurod4O09105 330 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc22a2O70577 553 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Camk4P08414 469 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scg5P12961 212 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wnt6P22727 364 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccnd1P25322 295 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LmnaP48678 665 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pde7aP70453 456 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gbp10Q000W5 611 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd244Q07763 397 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A1bgQ19LI2 512 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Foxr1Q3UTB7 268 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hesx1Q61658 185 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Samd4bQ80XS6 687 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8BWQ6 963 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Osbpl6Q8BXR9 959 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Frs2Q8C180 508 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Unc5aQ8K1S4 898 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Akr1c13Q8VC28 323 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc71Q8VEG0 433 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr570Q8VH12 312 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DhddsQ99KU1 333 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrpl17Q9D8P4 176 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Il22bQ9JJY8 179 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Angptl2Q9R045 493 aa13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm12695A2AGB2 545 aa13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm13285B1AYI3 182 aa13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm13275B1AYI8 182 aa13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prrt4B2RU40 902 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.1 ms