RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	KLHL2	O95198	593 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FAM107A	O95990	144 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ADRB3	P13945	408 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	BGN	P21810	368 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ACRV1	P26436	265 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ALDH3A1	P30838	453 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	NTSR1	P30989	418 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ETV3	P41162	512 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	P2RY2	P41231	377 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	PTGER3	P43115	390 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	LIG3	P49916	1009 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	COPA	P53621	1224 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	IRX4	P78413	519 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	B4GALNT1	Q00973	533 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SATB1	Q01826	763 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CREB5	Q02930	508 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGEF7	Q14155	803 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CST6	Q15828	149 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC153	Q494R4	210 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CGB2	Q6NT52	195 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	RAPH1	Q70E73	1250 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	LCA5	Q86VQ0	697 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CHPF	Q8IZ52	775 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	NAT14	Q8WUY8	206 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SCAMP4	Q969E2	229 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	DTD2	Q96FN9	168 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	GPR21	Q99679	349 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	IER2	Q9BTL4	223 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ABCG8	Q9H221	673 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	COPG2	Q9UBF2	871 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CD84	Q9UIB8	345 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	TLK1	Q9UKI8	766 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	IGF2R	P11717	2491 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	IQCF5	A8MTL0	148 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916		H3BMM5	538 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	TK2	O00142	265 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	KLF11	O14901	512 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	AP1G1	O43747	822 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SGTA	O43765	313 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ZBTB14	O43829	449 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	RHOBTB1	O94844	696 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	TSPAN12	O95859	305 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ADH1B	P00325	375 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	SOD1	P00441	154 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ESR1	P03372	595 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ELFN1	P0C7U0	828 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC166	P0CW27	439 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	CD1D	P15813	335 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	DRD1	P21728	446 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-222	ENST00000613916	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25

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